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研究探索SARS-CoV-2指數(shù)增長、高流行率及Delta相關(guān)疫苗有效性

發(fā)布日期:2021-12-24 瀏覽次數(shù):414

來源: 生物谷 

盡管疫苗接種率很高,但是冠狀病毒SARS-CoV-2感染的流行繼續(xù)推動著發(fā)病率和住院率,在許多人群中,由這種病毒的Delta變體引起的病例比例在增加。隨著疫苗接種計劃在全球范圍內(nèi)的展開和社交距離的放寬,SARS-CoV-2的未來趨勢并不確定。

自2020年5月以來,REACT-1(Real-time Assessment of Community Transmission–1)研究一直在跟蹤COVID-19大流行病在英格蘭的傳播?;谟⒏裉m5歲及以上人群的隨機樣本,該研究涉及每月2至3周內(nèi)從約10萬人或更多人那里獲取自制的咽拭子和鼻拭子進行逆轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(RT-PCR)檢測。除了拭子陽性的信息外,來自英國帝國理工學(xué)院等研究機構(gòu)的研究人員還收集人口統(tǒng)計學(xué)和其他潛在風(fēng)險因素的數(shù)據(jù),以及(自2021年1月起)疫苗接種史?;疾÷使烙嬛到?jīng)過加權(quán)處理,以代表整個英格蘭的人口。在此,他們利用REACT-1第12輪(2021年5月20日至2021年6月7日之間)和第13輪(2021年6月24日至7月12日之間)的RT-PCR拭子陽性數(shù)據(jù)來分析流行趨勢及其驅(qū)動因素?;貜?fù)率(response rate),即收到有效拭子結(jié)果的受邀者的百分比,在所有輪次中為20.4%,在第12輪和第13輪中分別為13.4%和11.7%。

這些研究人員觀察到,隨著英格蘭第三輪疫情的展開,再生數(shù)R在第12輪估計為1.44(95%可信區(qū)間為1.20,1.73),在第13輪為1.19(1.06,1.32),對應(yīng)于第12輪和第13輪的平均翻倍時間分別為11天(7,23天)和25天(15,>50天)。這導(dǎo)致平均加權(quán)患病率從第12輪的0.15%(0.12%,0.18%)(基于108911個有效拭子中的135個陽性)增加到第13輪的0.63%(0.57%,0.69%)(98233個有效拭子中的527個陽性)。不同輪次之間和每輪次內(nèi)的快速增長似乎是由Delta變體完全取代Alpha變體,以及在較年輕、較少接種疫苗的年齡組中的高流行率所驅(qū)動:在13至17歲的人群中,他們觀察到第12輪[0.16%(0.08%,0.31%)]和第13輪[1.56%(1.25%,1.95%)]之間加權(quán)流行率增加了9倍。在第13輪中,報告未接種疫苗者的加權(quán)患病率[1.21%(1.03%,1.41%)]比報告已接種兩劑疫苗者[0.40%(0.34%,0.48%)]高出3倍;然而,44%的感染發(fā)生在接種兩劑疫苗者身上,反映出盡管總體接種水平很高,但兩劑疫苗對感染的有效性仍不完善。

2021年期間,SARS-CoV-2變體替換導(dǎo)致感染上升,并引發(fā)了對疫苗抗感染有效性的擔(dān)憂。圖片來自Science, 2021, doi:10.1126/science.abl9551。

在18至64歲的參與者中,根據(jù)自我報告的疫苗接種情況,這些作者估計在第13輪中對感染的有效性(經(jīng)年齡、性別、地區(qū)、種族和多重貧困指數(shù)調(diào)整)為49%(95%置信區(qū)間為22%,67%),如果只考慮強陽性[周期閾值(Ct)低于27],則上升到58%(33%,73%)。對于同一年齡組,他們估計對感染的有效性調(diào)整后為59%(23%,78%),即在檢測前一個月報告一種或多種常見的COVID-19癥狀(發(fā)燒、嗅覺或味覺喪失或改變、新的持續(xù)咳嗽)的人群中。除年齡外,種族、家庭規(guī)模和當(dāng)?shù)氐呢毨С潭纫补餐瑢?dǎo)致了拭子陽性率較高的風(fēng)險。

綜上所述,從2021年5月底至7月初,在英國開展了非常成功的疫苗接種運動,疫苗接種率很高,但在未接種疫苗的年輕人中,Delta變體的感染流行率較高,推動感染呈指數(shù)增長。盡管2021年夏季北半球的增長速度放緩(或流行率持平或下降),但在Delta變體存在的情況下,增加的混合可能解釋了2021年秋季發(fā)生的重新增長,即使是在疫苗接種水平較高的人群中。

注:原文有刪減

參考資料:

Paul Elliott et al. Exponential growth, high prevalence of SARS-CoV-2, and vaccine effectiveness associated with the Delta variant. Science, 2021, doi:10.1126/science.abl9551.

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